La mission du CNOSM est de développer et de protéger le mouvement olympique conformément à la Charte Olympique. Pour accomplir sa mission, le CNOSM coopère avec les organismes gouvernementaux et non gouvernementaux. Le CNOSM a fait siens les principes fondamentaux de l’olympisme. A cet égard, il poursuit, conformément à la Charte Olympique, les objectifs suivants :
* Regrouper tous les organes de caractère national régissant les activités physiques et sportives, régulièrement déclarées ;
* Représenter le mouvement sportif malien pour toutes les questions d’intérêt général auprès des pouvoirs publics et des organisations officiels tant au Mali qu’à l’étranger, à l’exclusion des Fédérations Nationales et Organisations Africaines en dépendant ;
* Promouvoir le développement de la pratique du sport au Mali ;
* Contribuer à la vulgarisation de l’Olympisme dans les programmes d’enseignement et d’éducation physique et sportives dans les établissements scolaires et universitaires ;
* Agir contre toute forme de discrimination raciale, religieuse, politique, de sexe ou autre et combattre la violence dans le sport ;
* Lutter contre le dopage
* Œuvrer pour maintenir des relations d’harmonie et de coopération avec les organismes gouvernementaux et non gouvernementaux ;
* Propager les principes fondamentaux de l’Olympisme au niveau national dans le cadre de l’activité sportive (règle 28.2.2 de la Charte Olympique)
* Aider à la préparation des cadres sportifs (règles 28.2.4 de la Charte Olympique)